Se podrán realizar estudios de Doctorado en cualquiera de las líneas de investigación en las que estén involucrados los miembros del Departamento de Matemáticas de la Universidad Autónoma de Madrid:

Análisis armónico Geometría diferencial
Análisis complejo Geometría analítica
Análisis funcional Lógica
Métodos numéricos Matemática financiera
Ecuaciones en derivadas parciales Probabilidad
Estadística Teoría de números
Física matemática Teoría de grupos
Geometría algebraica Topología